Le , un contrôle du service de la comptabilité du CHUV met en avant une facture de 130 000 francs transmise par Julien Bogousslavsky et devant être payée à une entreprise parisienne inexistante la société Lortic[4] ; le contrôle administratif qui suit cette découverte permet de mettre au jour une trentaine de cas d'abus présumés portant sur environ 5,3 millions de francs suisses détournés, principalement pour financer sa passion pour les livres rares[5]. Le neurologue est alors licencié avec effet immédiat et passe quelques semaines en prison avant d'être libéré sous caution. Son procès a débuté le devant le Tribunal correctionnel de Lausanne.
En 2006, le journal l'Hebdo a révélé l'existence d'un catalogue, dressé par Julien Bogousslavsky, listant l'ensemble de ses ouvrages rares. Sur 153 pages, publiées sous le nom de « Lukas Jesus von Boilgy » (anagramme de son nom), il décrit et illustre 80 de ses plus précieux ouvrages, parmi lesquels un exemplaire numéroté de La prose du Transsibérien de Blaise Cendrars illustré par Sonia Delaunay ainsi que les Poésies de Stéphane Mallarmé illustrées par Henri Matisse[6]. Un exemplaire de ce catalogue est conservé à la Bibliothèque cantonale et universitaire à Dorigny sous la cote UPB 2895[7].