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Élève de Raymond Duncan — frère d'Isadora — en 1909, elle est adepte de la danse libre jusqu'en 1925 et crée elle-même ses costumes, ses scénographies et souvent sa musique. Elle est une pionnière concernant l'introduction de la danse moderne dans les ballets britanniques. Elle incorpore les positions grecques d'Isadora Duncan, notamment dans sa chorégraphie d'Orphée, inspirée de celle d'Orfeo de Christoph Willibald Gluck et dans son interprétation de l'Oiseau bleu basée sur celle de Maurice Maeterlinck.
Parallèlement, elle élabore une méthode d'éducation corporelle appliquée à la danse, à l'éducation physique, à l'école, au sport et à la thérapie.
En 1928, elle met au point un système de notation du mouvement, Danscript, connu sous l'appellation Margaret Morris Movement (MMM). Le siège de l'association internationale se trouve en Écosse, dans le West Dunbartonshire.
Elle s'arrête de danser en 1961, à la mort de son mari, le peintre John Duncan Fergusson.
