Exceptionnellement, les seize équipes ayant pris part à la phase de groupes prennent part à cette deuxième phase qui ne devait originellement concerner que douze d'entre elles. Les huitièmes et quarts de finale se jouent en matchs aller et retour selon un tableau prédéfini. La Finale à quatre est en revanche précédée d'un tirage au sort qui détermine les oppositions en demi-finales.
En raison de tests positifs au Covid-19 au RK Zagreb, le huitième de finale aller entre le club croate et Flensburg-Handewitt est d'abord reporté et inversé avant que toute la rencontre ne soit annulée car le RK Zagreb n'avait pas assez de joueurs pour disputer le match[1].
Du fait de restrictions sanitaires imposées par la Norvège, les deux matchs entre Elverum et Barcelone sont joués en Catalogne, les vendredi et lundi . Le FC Barcelone se qualifie sur le score cumulé de 76 à 44.
Le HBC Nantes se qualifie sur le score cumulé de 62 à 60.
Finale à quatre
La Finale à quatre (ou en anglais : Final Four) a lieu les et dans la Lanxess Arena de Cologne en Allemagne. Un tirage au sort détermine les équipes qui s'affrontent en demi-finales.