En 2000, son album solo entre dans le Top 10 des albums les plus vendus au Royaume-Uni. Il continue sa carrière artistique pour apparaître dans diverses productions théâtrales, entre autres dans la comédie musicaleJoseph and the Amazing Technicolor Dreamcoat, et dans différents programmes de télévision britanniques.
En 2008, il rejoint ses anciens partenaires du groupe Boyzone, reformé pour une grande tournée au Royaume-Uni. La même année le groupe sort Back Again… No Matter What, un best-of de leurs plus grands tubes, et deux nouveaux singles intitulés Love You Anyway et Better.
Le , Stephen Gately meurt d'un œdème pulmonaire[1], dû à une faiblesse cardiaque congénitale[2], alors qu'il est en vacances avec son compagnon dans sa propriété d'Andratx à Majorque[3]. Ses funérailles ont lieu le suivant dans l'église St Lawrence O'Toole à Dublin. Les quatre autres membres du groupe Boyzone sont présents, chantent pendant la cérémonie et portent son cercueil. Il repose au cimetière de Glasnevin de Dublin.