Marino è nato a West Islip, su Long Island (nello stato di New York), da una famiglia di origine italiana[1]. Ha studiato al Lee Strasberg Institute e alla Tisch School of the Arts della New York University (NYC).
Ha visto i primi successi televisivi nel 1993 come membro della troupe comica, della quale fu anche uno dei membri fondatori, che animava la serie comica The State su MTV. Ha avuto ruoli ricorrenti nelle serie TV Dawson's Creek (2001-2002), impersonando il Prof. Wilder, e in You Wrote It, You Watch It (1992).
Ha recitato in diverse puntate di Streghe e Rock Me Baby, e ha avuto un ruolo ricorrente nelle tre stagioni della serie TV Veronica Mars con il personaggio del detective privato Vincent "Vinnie" Van Lowe. Nel 2003 ha interpretando il ruolo del Dr. Turner in un episodio L'ospedale di Le cose che amo di te.
Marino era stato scelto per recitare nel remake della serie tv The Courtship of Eddie's Father, ma la puntata pilota non è mai andata in onda. Invece è stato scelto per la serie Party Down, mandata in onda da Starz (un canale PayTv americano). Ha recitato anche, nel ruolo di demone gay, nel serial TV Reaper(2008).
Inoltre è stato guest star in un episodio della terza stagione di Will & Grace (Nessuno è perfetto - There's a Crowd, Six is a Freaky Show) dove ha interpretato il fidanzato a sei dita di Grace, nella prima stagione di Angel, in due episodi della serie Reno 911, nella prima stagione di Stella e nella seconda stagione di Grey's Anatomy.
Nel 2009, ha avuto un cameo in un episodio della serie Californication e uno nella serie Angel. Dal 2014 recita nella serie TV Marry Me.
Marino ha scritto la sceneggiatura del film Diggers (2007), ambientato nella metà degli anni '70 a Long Island, sempre nel 2007 è interprete e co-sceneggiatore, insieme a David Wain, di The Ten.
Vita privata
Marino è sposato con l'attrice/scrittrice Erica Oyama, con la quale ha avuto un figlio, Riley Ken'ichi Marino ed una figlia, Ruby.
Nelle versioni italiano delle opere in cui ha recitato, Ken Marino è stato doppiato da:
Vittorio Guerrieri in Will & Grace, First Years, Wet Hot American Summer, Reaper - In missione per il Diavolo, Role Models, In a World... - Ascolta la mia voce, Wet Hot American Summer: First Day of Camp, Wet Hot American Summer: Ten Years Later
Francesco Prando in Dawson's Creek, iZombie, Medical Police, Le regole del delitto perfetto
^Ken Marino Interview at, su thecinemasource.com, 28 gennaio 2008. URL consultato il 24 gennaio 2013 (archiviato dall'url originale il 20 novembre 2008).