Ver artigo principal: Copa Libertadores da América de 2008

A fase final da Copa Libertadores da América de 2008 compreendeu as disputas de oitavas de final, quartas de final, semifinal e final. As equipes se enfrentaram em jogos eliminatórios de ida e volta, e a que somasse mais pontos classifica-se a fase seguinte. Se as equipes igualassem em pontos, o primeiro critério de desempate seria o saldo de gols, caso empatesse o saldo de gols, o gol marcado na casa do adversário entraria em consideração. Persistindo o empate, a vaga seria decidida por disputa de pênaltis.

Para determinar todos os cruzamentos da fase final, foi levado em conta o desempenho de todas as equipes na fase de grupos. As equipes dividiram-se de 1º a 8º (primeiros colocados nos grupos) e de 9º a 16º (segundo colocados). A melhor equipe enfrenta a 16ª, a 2ª contra a 15ª, e assim sucessivamente.

Pos Primeiros dos grupos Pts J V E D GP GC SG 1 Fluminense 13 6 4 1 1 11 3 8 2 Flamengo 13 6 4 1 1 9 4 5 3 River Plate 12 6 4 0 2 14 8 6 4 Atlas 11 6 3 2 1 11 6 5 5 Cruzeiro 11 6 3 2 1 11 7 4 6 Estudiantes 11 6 3 2 1 9 5 4 7 Cúcuta 11 6 3 2 1 7 4 3 8 São Paulo 11 6 3 2 1 6 4 2

Pos Segundos dos grupos Pts J V E D GP GC SG 9 Nacional 12 6 4 0 2 9 5 4 10 Santos 10 6 3 1 2 13 6 7 11 LDU Quito 10 6 3 1 2 10 5 5 12 Boca Juniors 10 6 3 1 2 12 9 3 13 Lanús 10 6 2 4 0 9 6 3 14 San Lorenzo 10 6 3 1 2 8 7 1 15 América 9 6 3 0 3 10 10 0 16 Atlético Nacional 8 6 2 2 2 8 5 3

Chave	Equipe 1	Total	Equipe 2	Ida	Volta
A	Fluminense	3–1	Atlético Nacional	2–1	1–0
B	Flamengo	4–5	América	4–2	0–3
C	River Plate	3–4	San Lorenzo	1–2	2–2
D	Atlas	3–2	Lanús	1–0	2–2
E	Cruzeiro	2–4	Boca Juniors	1–2	1–2
F	Estudiantes	2–3	LDU Quito	0–2	2–1
G	Cúcuta Deportivo	0–4	Santos	0–2	0–2
H	São Paulo	2–0	Nacional	0–0	2–0

Todas as partidas estão no horário local

30 de abril de 2008 20:00	Atlético Nacional	1 – 2	Fluminense	Estádio Atanasio Girardot, Medellin Público: Árbitro: Martín Vázquez (URU)
	Arrué 52'	Relatório	Thiago Neves 21' (pen) Conca 75'

6 de maio de 2008 18:30	Fluminense	1 – 0	Atlético Nacional	Estádio do Maracanã, Rio de Janeiro Público: 31.700 Árbitro: Victor Hugo Rivera (PER)
	Roger 52'	Relatório

30 de abril de 2008 17:45	América	2 – 4	Flamengo	Estádio Azteca, Cidade do México Público: Árbitro: Carlos Chandia (CHI)
	Cervantes 45' Esqueda 71'	Relatório	Marcinho 43', 69' Diego Tardelli 87' Léo Moura 92'

7 de maio de 2008 21:50	Flamengo	0 – 3	América	Estádio do Maracanã, Rio de Janeiro Público: 47.115 Árbitro: Alfredo Intriago (ECU)
		Relatório	Cabañas 20', 77' Esqueda 38'

30 de abril de 2008 19:45	San Lorenzo	2 – 1	River Plate	Estádio Nuevo Gasómetro, Buenos Aires Público: 25.337 Árbitro: Héctor Baldassi (ARG)
	Silvera 27' González 87' (pen)	Relatório	Falcao García 30'

8 de maio de 2008 20:30	River Plate	2 – 2	San Lorenzo	Estádio Monumental de Nuñez, Buenos Aires Público: 49.983 Árbitro:Sergio Pezzotta (ARG)
	Abelairas 12' Abreu 62' (pen)	Relatório	Bergessio 69', 72'

29 de abril de 2008 20:10	Lanús	0 – 1	Atlas	Estádio Ciudad de Lanús, Lanús Público: 6.104 Árbitro: Victor Hugo Rivera (PER)
		Relatório	Marioni 37'

6 de maio de 2008 21:30	Atlas	2 – 2	Lanús	Estádio Jalisco, Guadalajara Público: Árbitro: Carlos Torres (PAR)
	Marioni 29' Mendivil 78'	Relatório	Sand 64' Acosta 90'

30 de abril de 2008 17:40	Boca Juniors	2 – 1	Cruzeiro	Estádio La Bombonera, Buenos Aires Público: 35.137 Árbitro: Jorge Larrionda (URU)
	Riquelme 6' Datolo 65'	Relatório	Fabrício 77'

7 de maio de 2008 19:10	Cruzeiro	1 – 2	Boca Juniors	Estádio Mineirão, Belo Horizonte Público: 61.471 Árbitro: Carlos Chandía (CHI)
	Wagner 56'	Relatório	Palacio 36' Palermo 44'

29 de abril de 2008 20:30	LDU Quito	2 – 0	Estudiantes	Estádio La Casa Blanca, Quito Público: 17.540 Árbitro: Leonardo Gaciba (BRA)
	Guerrón 63' Manso 77'	Relatório

6 de maio de 2008 21:00	Estudiantes	2 – 1	LDU Quito	Estádio Ciudad de La Plata, La Plata Público: Árbitro: Oscar Ruiz (COL)
	Alayes 46' Maggiolo 66'	Relatório	Bolaños 25'

1 de maio de 2008 20:45	Santos	2 – 0	Cúcuta	Estádio Vila Belmiro, Santos Público: 17.282 Árbitro: Marco Rodríguez (MEX)
	Lima 18' Molina 71'	Relatório

8 de maio de 2008 21:15	Cúcuta	0 – 2	Santos	Estádio General Santander, Cúcuta Público: Árbitro: Carlos Amarilla (PAR)
		Relatório	Kléber Pereira 39' Lima 53'

30 de abril de 2008 22:00	Nacional	0 – 0	São Paulo	Estádio Parque Central, Montevideo Público: Árbitro: Rubén Selman (CHI)
		Relatório

7 de maio de 2008 21:50	São Paulo	2 – 0	Nacional	Estádio do Morumbi, São Paulo Público: 42.050 Árbitro: Héctor Baldassi (ARG)
	Adriano 37' Dagoberto 88'	Relatório

Chave	Equipe 1	Total	Equipe 2	Ida	Volta
S1	Fluminense	3–2	São Paulo	0–1	3–1
S2	Santos	1–2	América	0–2	1–0
S3	LDU Quito	2–2 (5–3 p)	San Lorenzo	1–1	1–1
S4	Atlas	2–5	Boca Juniors	2–2	0–3

Todas as partidas estão no horário local

14 de maio de 2008 21:50	São Paulo	1 – 0	Fluminense	Estádio do Morumbi, São Paulo Público: 61.593 Árbitro: Oscar Ruiz (COL)
	Adriano 19'	Relatório

21 de maio de 2008 21:50	Fluminense	3 – 1	São Paulo	Estádio do Maracanã, Rio de Janeiro Público: 68.191 Árbitro: Carlos Amarilla (PAR)
	Washington 12', 90+1' Dodô 71'	Relatório	Adriano 70'

15 de maio de 2008 19:20	América	2 – 0	Santos	Estádio Azteca, Cidade do México Público: Árbitro: Héctor Baldassi (ARG)
	Cabañas 25', 62'	Relatório

22 de maio de 2008 21:50	Santos	1 – 0	América	Estádio Vila Belmiro, Santos Público: 19.539 Árbitro: Jorge Larrionda (URU)
	Kléber Pereira 63'	Relatório

15 de maio de 2008 19:00	San Lorenzo	1 – 1	LDU Quito	Estádio Nuevo Gasómetro, Buenos Aires Público: Árbitro: Carlos Simon (BRA)
	González 38'	Relatório	Bieler 36'

22 de maio de 2008 17:30	LDU Quito	1 – 1	San Lorenzo	Estádio La Casa Blanca, Quito Público: Árbitro: Marco Rodríguez (MEX)
	Manso 26'	Relatório	Bergessio 47'

		Penalidades
	Urrutia Campos Vaca Guerrón Bieler	5 – 3	González D'Alessandro Torres Alvarado

14 de maio de 2008 19:20	Boca Juniors	2 – 2	Atlas	Estádio José Amalfitani, Buenos Aires Público: Árbitro: Wilmar Roldán (COL)
	Ayala 36' (g.c.) Cáceres 75'	Relatório	Omar Flores 5' Torres 88'

21 de maio de 2008 17:20	Atlas	0 – 3	Boca Juniors	Estádio Jalisco, Guadalajara Público: Árbitro: Rubén Selman (CHI)
		Relatório	Palermo 19', 33', 37'

Segundo o regulamento, se dois times do mesmo país passarem às semifinais, os confrontos serão alterados de forma a esses dois times se enfrentarem nessa fase, alterando os cruzamentos pré-determinados.

Chave	Equipe 1	Total	Equipe 2	Ida	Volta
F1	Fluminense	5-3	Boca Juniors	2-2	3-1
F2	LDU Quito	1-1	América	1-1	0-0

28 de maio de 2008 21:50	Boca Juniors	2 – 2	Fluminense	Estádio Juan Domingo Perón, Buenos Aires Público: Árbitro: Roberto Silvera (URU)
	Riquelme 11', 64'	Relatório	Thiago Silva 15' Thiago Neves 76'

4 de junho de 2008 21:50	Fluminense	3 – 1	Boca Juniors	Maracanã, Rio de Janeiro Público: 78.856 Árbitro: Carlos Torres (PAR)
	Washington 62' Conca 70' Dodô 90+2'	Relatório	Palermo 57'

27 de maio de 2008 21:50	América	1 – 1	LDU Quito	Estádio Azteca, Cidade do México Público: Árbitro: Martín Vázquez (URU)
	Esqueda 72'	Relatório	Bolaños 62'

3 de junho de 2008 21:50	LDU Quito	0 – 0	América	Estádio Casablanca, Quito Público: 28.336 Árbitro: Pablo Pozo (CHI)
		Relatório

O campeão da Libertadores 2008 tem direito de participar do Campeonato Mundial de Clubes da FIFA 2008, caso o time campeão seja integrante de uma confederação sul-americana de futebol. Times do México não têm direito de participar do Campeonato Mundial de Clubes como representante da CONMEBOL, organizadora do evento.

Além do Mundial de Clubes, o campeão da Libertadores 2008 adquire o direito de participar da Recopa Sul-Americana 2009, contra o campeão da Copa Sul-Americana 2008.

Equipe 1	Total	Equipe 2	Ida	Volta
Fluminense	5-5 (1-3 pen)	LDU Quito	2-4	3-1

LDU	Fluminense

25 de junho de 2008 21:50	LDU Quito	4 – 2	Fluminense	Estádio Casablanca, Quito Público: 26.662 Árbitro: Carlos Chandía (CHI)
	Bieler 2' Guerrón 29' Campos 34' Urrutia 45'	Relatório	Conca 12' Thiago Neves 52'

Fluminense

LDU

2 de julho de 2008 21:50	Fluminense	3 – 1 (pro)	LDU Quito	Maracanã, Rio de Janeiro Público: 78.918 Árbitro: Héctor Baldassi (ARG)
	Thiago Neves 12', 28', 58'	Relatório	6' Bolanõs

		Penalidades
	Conca: Thiago Neves: Cícero: Washington:	1–3	Urrutia: Campos: Salas: Guerrón:

• Copa Libertadores da América de 2008 - Primeira fase
• Copa Libertadores da América de 2008 - Segunda fase

• «Libertadores 2008 em CONMEBOL.com» (em espanhol)