Em 15 de janeiro de 2009, ele assinou contrato com o Vissel Kobe.[1]Em 19 de dezembro de 2011, confirmou sua aposentadoria em uma conferência de imprensa na tarde de segunda-feira em Kobe, no Japão.[2]
Seleção
Miyamoto participou de 71 partidas internacionais e liderou a seleção nacional do Japão nas Copas do Mundo de 2002 e 2006[3], bem como a Copa da Ásia de 2004. Miyamoto também capitaneou o Gamba Osaka durante a temporada do campeonato da Liga J1 de 2005.[4]
Com Ivica Osim assumindo a seleção nacional de Zico em 2006, o Japão viu uma verdadeira limpa e Miyamoto foi um dos muitos que provavelmente jogou seu último jogo para a seleção japonesa. Em dezembro de 2006, Miyamoto assinou por 1 temporada com Red Bull Salzburg[5] com uma opção para outra temporada. Em dezembro de 2007, ele assinou um novo acordo com o clube austríaco até 2009.[3][6]
Treinador
Em 2018, assumiu o clube principal do Gamba Osaka.