Военный штаб Европейского союза подчиняется военному комитету ЕС и обеспечивает его работу, в частности, в вопросах стратегического планирования и раннего оповещения о возможных угрозах.
На должность директора военного штаба ЕС назначается один из представителей стран - участниц организации в звании генерал-лейтенант (вице-адмирал). При этом председатель военного комитета (генерал армии либо адмирал) и директор военного штаба не могут быть представителями одного государства[2].
Организационно военный штаб состоит из шести управлений: военного планирования; разведывательного; кризисного регулирования, оперативной и боевой подготовки; ресурсов и тылового обеспечения; связи и информационных систем; отдел координации с командованием НАТО. Во главе каждого управления находится бригадный генерал[3].
Военное планирование
Управление военного планирования формирует оборонную доктрину ЕС, отвечая за развитие и подготовку вооружённых сил Евросоюза и взаимодействуя с Европейским оборонным агентством[4].
Разведка
Задачи разведывательного управления касаются оповещения о возможных угрозах странам Евросоюза[4].
Боевая подготовка
Управление оперативной и боевой подготовки несёт ответственность за проведение учений и боевых миссий[4].
Тыловое обеспечение
Управление тылового обеспечения служит как для материально-технического снабжения войск, так и для их административной поддержки[4].
Связь и информационные системы
Управление связи и информационных систем не только даёт публичные разъяснения о проводимой военной политике ЕС, но и гарантирует военнослужащим надёжную коммуникацию как во время учений, так и в ходе выполнения ими боевых миссий за пределами Европейского союза[4].
Координация с командованием НАТО
Отдел координации с командованием НАТО отвечает за взаимодействие со штаб-квартирой Североатлантического альянса в условиях кризисных ситуаций[4].