Начало Великой Отечественной войны С-17 встретила на заводе № 112 в достройке, степень готовности оценивалась в 70,3 %. Осенью 1941 года строительство было остановлено и было возобновлено только летом 1942 года. Постройка велась неспешно, ввиду перепрофилирования «Красного Сормова» на выпуск танков. Так как завод неоднократно срывал сроки завершения строительства, 9-21 мая 1944 года лодку перевели через Архангельск в Молотовск на завод № 402 для достройки. Приёмные испытания завершились 20 апреля 1945 года подписанием приёмного акта. Военно-морской флаг был поднят 20 мая, а в состав флота лодка вошла 9 июня 1945 года, и в боевых действиях ей принять участие не довелось.
До 29 декабря 1955 года С-17 продолжала службу в составе Северного флота, после чего прослужила ещё около двух лет как плавучая зарядовая станция ПЗС-29 и ЗАС-4.
12 марта 1958 года лодку исключили из списка плавсредств флота и списали на слом.
Морозов М. Э., Кулагин К. Л. «Эски» в бою. Подводные лодки Маринеско, Щедрина, Лисина. — М.: Коллекция, Яуза, ЭКСМО, 2008. — 128 с. — ISBN 978-5-699-25627-3.
Платонов А. В. Энциклопедия советских подводных лодок 1941—1945. — М.: АСТ, 2004. — 592 с. — 3000 экз. — ISBN 5-17-024904-7.