Заснований у 1974 році з метою «підняти соціально-економічний та моральний стан молоді Сан-Хуана та його передмість». Після заснування Футбольною асоціацією Тринідаду і Тобаго напівпрофесіональної ліги в 1994 році «Сан-Хуан Джаблоті» перетворився з молодіжної команди в професіональний футбольний клуб. За підтримки CL Financial у 1996 році клуб значно розширив свою діяльність. З 1997 по 1999 рік команда тричі поспіль фінішувала на четвертому місці у напівпрофесіональній лізі.
Після створення першої професіональної ліги Тринідаду і Тобаго в 1999 році «Сан-Хуан Джаблоті» став одним із засновників ліги. З моменту заснування турніру клуб був найуспішнішим клубом ліги, вигравши чемпіонат у 2002, 2003/04, 2007 та 2008 роках. «Сан-Хуан Джаблоті» також представляв країну на Кубку Чемпіонів КОНКАКАФ у 2004 році.
Спочатку розформував юнацькі та молодіжні команди, а в липні 2012 року клуб вирішив розформувати й головну команду, яка виступала в Про лізі ТТ. Натомість клуб вирішив сконцентрувати увагу на нетболі.
Досягнення
Національні
Про Ліга ТТ
Чемпіон (4): 2002, 2003/04, 2007, 2008
Кубок ТТ
Володар (2): 1998, 2005
Кубок Перших Городян
Володар (2): 2000, 2003
Фіналіст (1): 2005
Digicel Pro Bowl
Володар (3): 2003, 2005, 2006
Фіналіст (2): 2001, 2004
TOYOTA Classic
Володар (1): 2008
Фіналіст (2): 2007, 2009
Міжнародні турніри
Клубний кубок Карибського басейну
Чемпіон (1): 2003
Срібний призер (1): 2006
Бронзовий призер (1): 2009
Статистика виступів
Сезон
Сезон чемпіонату
Трофей ФА
Кубок Перших городян
Digicel Pro Bowl
TOYOTA Classic
Lucozade Sport Goal Shield
Клубнний чемпіонат КФС
Ліга чемпіонів КОНКАКАФ
Місце в чемпіонаті
Велика 6-а
1997
4-е
Стартував у 2004
Невідомо
Стартував у 2000
Стартував у 2001
Стартував у 2005
Стартував у 2009
Не кваліфікувався
1998
4-е
Чемпіони
1/4 фіналу
Не кваліфікувався
1999
4-е
Невідомо
Не відбувся
Не кваліфікувався
2000
3-є
1/2 фіналу
Чемпіони
Не кваліфікувався
2001
5-е
1/4 фіналу
Не кваліфікувався
Фінал
Не кваліфікувався
Не відбувся
2002
Чемпіони
1/2 фіналу
1/2 фіналу
1/4 фіналу
Не кваліфікувався
2003–04
Чемпіони
1/8 фіналу
Чемпіони
Чемпіони
Чемпіони
Не кваліфікувався
2004
3-є
Переможець
Залишив турнір
1/4 фіналу
Фінал
1/2 фіналу
1/4 фіналу
2005
2-е
6-е
Чемпіони
Фінал
Чемпіони
1/2 фіналу
Не кваліфікувався
2006
3-є
Переможці
1/4 фіналу
1/2 фіналу
Чемпіони
1/4 фіналу
Фінал
Не кваліфікувався
2007
Чемпіони
4-е
1/2 фіналу
3-є місце
1/4 фіналу
Фінал
4-е місце
Не кваліфікувався
2008
Чемпіони
Переможці
1/4 фіналу
4-е місце
1/4 фіналу
Чемпіони
Не відбувся
Не кваліфікувався
2009
2-е
2-е
1/8 фіналу
1/2 фіналу
1/4 фіналу
Фінал
1/2 фіналу
3-є місце
Не кваліфікувався
2010
Завершився у 2009 2009
3-є місце
Груповий етап
2011
Попередній
Статистика виступів у континентальних змаганнях
Клубний кубок КФС 1998:
1/4 фіналу v. Оглон дю Ламентен – 0:2
Клубний кубок КФС 2003
1/2 фіналу v. «Арнетт Гарденс» – 3:1, 1:3 («Сан-Хуан Джаблоті» переміг з загальним рахунком 6:2)