FOXH1
|
---|
|
Ідентифікатори
|
---|
Символи
| FOXH1, FAST-1, FAST1, forkhead box H1 |
---|
Зовнішні ІД |
OMIM: 603621 MGI: 1347465 HomoloGene: 2914 GeneCards: FOXH1
|
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція |
• co-SMAD binding • GO:0001104 transcription coregulator activity • protein domain specific binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • androgen receptor binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • bHLH transcription factor binding • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • R-SMAD binding • SMAD binding • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
---|
Клітинна компонента |
• нуклеоплазма • activin responsive factor complex • transcription regulator complex • клітинне ядро
|
---|
Біологічний процес |
• ventricular trabecula myocardium morphogenesis • anterior/posterior pattern specification • negative regulation of androgen receptor signaling pathway • embryonic heart tube anterior/posterior pattern specification • transcription, DNA-templated • outflow tract morphogenesis • nodal signaling pathway involved in determination of lateral mesoderm left/right asymmetry • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • heart looping • axial mesoderm development • cardiac right ventricle morphogenesis • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • determination of left/right symmetry • secondary heart field specification • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • aorta morphogenesis • transcription by RNA polymerase II • negative regulation of intracellular estrogen receptor signaling pathway • transforming growth factor beta receptor signaling pathway • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • cellular response to cytokine stimulus • anatomical structure morphogenesis • диференціація клітин • negative regulation of DNA-binding transcription factor activity
|
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | | Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних
| Ортологи |
---|
Види |
Людина |
Миша |
---|
Entrez | |
|
---|
Ensembl |
|
|
---|
UniProt |
|
|
---|
RefSeq (мРНК) |
| |
---|
RefSeq (білок) |
| |
---|
Локус (UCSC) |
Хр. 8: 144.47 – 144.48 Mb
| Хр. 15: 76.55 – 76.55 Mb
|
---|
PubMed search |
[1]
| [2] |
---|
Вікідані | |
FOXH1 (англ. Forkhead box H1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 365 амінокислот, а молекулярна маса — 39 257[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MGPCSGSRLG | | PPEAESPSQP | | PKRRKKRYLR | | HDKPPYTYLA | | MIALVIQAAP |
SRRLKLAQII | | RQVQAVFPFF | | REDYEGWKDS | | IRHNLSSNRC | | FRKVPKDPAK |
PQAKGNFWAV | | DVSLIPAEAL | | RLQNTALCRR | | WQNGGARGAF | | AKDLGPYVLH |
GRPYRPPSPP | | PPPSEGFSIK | | SLLGGSGEGA | | PWPGLAPQSS | | PVPAGTGNSG |
EEAVPTPPLP | | SSERPLWPLC | | PLPGPTRVEG | | ETVQGGAIGP | | STLSPEPRAW |
PLHLLQGTAV | | PGGRSSGGHR | | ASLWGQLPTS | | YLPIYTPNVV | | MPLAPPPTSC |
PQCPSTSPAY | | WGVAPETRGP | | PGLLCDLDAL | | FQGVPPNKSI | | YDVWVSHPRD |
LAAPGPGWLL | | SWCSL |
Кодований геном білок за функцією належить до активаторів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
Примітки
Див. також
|
---|
(1) Основні домени |
---|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
---|
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
---|
(1.4) NF-1 | |
---|
(1.5) RF-X | |
---|
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
---|
|
| (2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | підродина 1 | |
---|
підродина 2 | |
---|
підродина 3 | |
---|
підродина 4 | |
---|
підродина 5 | |
---|
підродина 6 | |
---|
підродина 0 | |
---|
|
---|
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
---|
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
---|
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
---|
(2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
---|
(2.6) WRKY | |
---|
|
| (3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
(3.1) Гомеобокс | |
---|
(3.2) Парний бокс | |
---|
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
---|
(3.4) Фактори теплового шоку | |
---|
(3.5) Триптофановий кластер | |
---|
(3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
---|
|
| (4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
(4.1) RHR | |
---|
(4.2) STAT | |
---|
(4.3) p53 | |
---|
(4.4) MADS | |
---|
(4.6) TATA | |
---|
(4.7) Високомобільна група | |
---|
(4.9) Grainyhead | |
---|
(4.10) Домен холодового шоку | |
---|
(4.11) Runt | |
---|
|
| (0) Інші фактори транскрипції |
---|
(0.2) HMGI(Y) | |
---|
(0.3) Pocket домен | |
---|
(0.5) AP2/EREBP-подібні | |
---|
(0.6) Інші | |
---|
|
|
Information related to FOXH1 |