NRF1
Ідентифікатори
Символи
NRF1 , ALPHA-PAL, nuclear respiratory factor 1
Зовнішні ІД
OMIM : 600879 MGI: 1332235 HomoloGene: 3674 GeneCards: NRF1
Пов'язані генетичні захворювання
ожиріння [ 1]
Онтологія гена
Молекулярна функція
• DNA binding • protein homodimerization activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • core promoter sequence-specific DNA binding • RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
Клітинна компонента
• екзосома • нуклеоплазма • гіалоплазма • клітинне ядро
Біологічний процес
• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • mitochondrion organization • generation of precursor metabolites and energy • transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 7: 129.61 – 129.76 Mb
Хр. 6: 30.05 – 30.15 Mb
PubMed search
[ 2]
[ 3] Вікідані
NRF1 (англ. Nuclear respiratory factor 1 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[ 4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 503 амінокислот , а молекулярна маса — 53 541[ 5] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MEEHGVTQTE HMATIEAHAV AQQVQQVHVA TYTEHSMLSA DEDSPSSPED
TSYDDSDILN STAADEVTAH LAAAGPVGMA AAAAVATGKK RKRPHVFESN
PSIRKRQQTR LLRKLRATLD EYTTRVGQQA IVLCISPSKP NPVFKVFGAA
PLENVVRKYK SMILEDLESA LAEHAPAPQE VNSELPPLTI DGIPVSVDKM
TQAQLRAFIP EMLKYSTGRG KPGWGKESCK PIWWPEDIPW ANVRSDVRTE
EQKQRVSWTQ ALRTIVKNCY KQHGREDLLY AFEDQQTQTQ ATATHSIAHL
VPSQTVVQTF SNPDGTVSLI QVGTGATVAT LADASELPTT VTVAQVNYSA
VADGEVEQNW ATLQGGEMTI QTTQASEATQ AVASLAEAAV AASQEMQQGA
TVTMALNSEA AAHAVATLAE ATLQGGGQIV LSGETAAAVG ALTGVQDANG
LVQIPVSMYQ TVVTSLAQGN GPVQVAMAPV TTRISDSAVT MDGQAVEVVT
LEQ
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів , фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції , альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
Література
Virbasius C.A., Virbasius J.V., Scarpulla R.C. (1993). NRF-1, an activator involved in nuclear-mitochondrial interactions, utilizes a new DNA-binding domain conserved in a family of developmental regulators . Genes Dev . 7 : 2431—2445. PMID 8253388 doi :10.1101/gad.7.12a.2431
Gopalakrishnan L., Scarpulla R.C. (1995). Structure, expression, and chromosomal assignment of the human gene encoding nuclear respiratory factor 1. J. Biol. Chem . 270 : 18019—18025. PMID 7629110 doi :10.1074/jbc.270.30.18019
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi :10.1101/gr.2596504
Spelbrink J.N., Van den Bogert C. (1995). The pre-mRNA of nuclear respiratory factor 1, a regulator of mitochondrial biogenesis, is alternatively spliced in human tissues and cell lines. Hum. Mol. Genet . 4 : 1591—1596. PMID 8541844 doi :10.1093/hmg/4.9.1591
Gugneja S., Scarpulla R.C. (1997). Serine phosphorylation within a concise amino-terminal domain in nuclear respiratory factor 1 enhances DNA binding. J. Biol. Chem . 272 : 18732—18739. PMID 9228045 doi :10.1074/jbc.272.30.18732
Andersson U., Scarpulla R.C. (2001). Pgc-1-related coactivator, a novel, serum-inducible coactivator of nuclear respiratory factor 1-dependent transcription in mammalian cells . Mol. Cell. Biol . 21 : 3738—3749. PMID 11340167 doi :10.1128/MCB.21.11.3738-3749.2001
Примітки
Див. також
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші
Information related to NRF1