Клюйверт був частиною золотого покоління «Аякса»1990-х років. Він прийшов в «Аякс» з молодіжної академії і дебютував в основній команді 21 серпня 1994 року в віці 18 років в Суперкубку Нідерландів проти «Феєнорда» і в тому ж матчі забив свій перший гол. У сезоні 1994/1995 до «Аяксу» з молодіжної команди приєдналися також Едгар Давідс, Кларенс Зедорф і Едвін ван дер Сар, які разом виграли Лігу чемпіонів в сезоні 1994/95. Саме Клюйверт забив єдиний м'яч у ворота італійського «Мілана» на 85-ій хвилині фінального матчу.
1997 року Клюйверт відмовився від нового контракту і перейшов як вільний агент в «Мілан». Його кар'єра в новому клубі розпочалася добре, коли він забив гол у ворота «Ювентуса» у товариській зустрічі. Однак у цей час у Патріка почалися проблеми. Клюйверт на смерть збив пішохода, отримавши в покарання громадські роботи і довічну заборону на водіння автомобіля. Також його звинуватили в зґвалтуванні, проте пізніше виправдали через відсутність доказів. Зважаючи на ці проблеми, в Італії він провів лище один сезон 1997/98, у якому йому вдалося забити лише 6 голів.
У 1998 році Клюйверт відправився в «Барселону», де відразу ж закріпився в основі і разом з Рівалдо і Луїшем Фігу сформував потужний атакувальний трикутник. З Клюйвертом Барселона виграла в 1999 році чемпіонат Іспанії. Всього за «Барсу» він зіграв 182 матчі і забив 90 голів. Після того, як до клубу прийшов бразилець Роналдінью, Патрік вже не так часто почав виходити на поле.
У 2004 році він відправився на Туманний Альбіон в «Ньюкасл Юнайтед», де Клюйверт грав в атаці в парі з Аланом Ширером. Патрік почав яскраво виступати за новий клуб, але постійні травми коліна не дозволили йому зіграти другу частину сезону. Клюйверт не захотів підписувати новий контракт і вирішив повернутися до Іспанії.
Новим клубом Клюйверта стала «Валенсія». Примітно, що його контракт містив пункт, який дозволяв клубу звільнити футболіста у разі недисциплінованої поведінки поза межами поля. Травма знову завадила Патріку проявити себе, за «Валенсію» він зіграв всього 202 хвилини і в кінці сезону став шукати інший клуб. Такому перебігу подій керівництво «Валенсії» не перешкоджало.
Незважаючи на чутки про повернення Клюйверта в рідний «Аякс», новим клубом Патріка став один із найпринциповіших суперників амстердамців — «ПСВ Ейндговен», з яким футболіст підписав контракт на рік. Дві травми в першій половині сезону в черговий раз перешкодили Клюйверту чогось досягти — в 16 зіграних матчах він забив лише тричі. У грі з
«Аяксом» на «Філіпс Стадіон» Патрік не став святкувати забитий ним гол у ворота його колишньої команди. В кінці сезону ні в ПСВ, ні сам Клюйверт не виявили бажання продовжувати контракт.
Відмовившись від запрошення «Шеффілд Венсдей», Клюйверт перейшов у французький «Лілль», у якому знову не продемонстрував колишнього рівня гри і за підсумками сезону знову не підписав новий контракт з клубом. Влітку 2008 року Патрік перебрався до нідерландського клубу АЗ (Алкмаар), де працював помічником головного тренера Луї ван Галя. У новому сезоні продовжить свою тренерську кар'єру в ПСВ, де буде працювати з молодіжною командою.
Перший гол забив у матчі кваліфікації на Євро-96 проти збірної Ірландії. Тоді його дубль приніс команді перемогу з
рахунком 2-0. Справжнім тріумфом став домашній для нідерландців Євро-2000. Збірна «золотого покоління» показала феєричну гру в груповому турнірі, в якому Клюйверт забив по голу збірної Данії та Франції, а потім нідерландці геть розбили збірну Югославії з рахунком 6-1 у чвертьфіналі. Клюйверт забив у тому матчі 3 голи. До кінця поєдинку
залишалося спірним питання, чи забив він четвертий гол, але після матчу Патрік сказав, що Деян Говедариця зрізав м'яч у ворота. В підсумку, Клюйверт став найкращим бомбардиром Євро-2000 разом із югославом Саво Мілошевичем з п'ятьма голами, і увійшов до символічної збірної турніру. У півфіналі нідерландці поступилися збірній Італії по пенальті
(0:0; 1:3 пен.) і розділили у підсумку 3-4 місце. У тому півфіналі Клюйверт не забив пенальті в основний час матчу, спрямувавши м'яч у штангу, а в післяматчевій серії пенальті єдиним з голландців зміг переграти Франческо Тольдо.
Після того турніру кар'єра Клюйверта у збірній пішла на спад. Команда не пройшла кваліфікацію на Чемпіонат світу в Японії та Кореї, програвши головним конкурентам — Португалії (0:2) та Ірландії (0:1). Не зігравшись з іншим форвардом, Рудом ван Ністелроєм, Патрік став виходити в основному на заміну, і то в товариських матчах. На Євро-2004 в Португалії він став єдиним польовим гравцем із заявлених на турнір, хто жодного разу не вийшов на поле. З тих пір, після призначення Марко ван Бастена у 2004 році головним тренером збірної, до збірної Патрік не викликався. Останній гол за національну команду Клюйверт забив у ворота збірної Молдови11 жовтня2003 року, останній матч — проти Ірландії5 червня2004.
За збірну Клюйверт зіграв 79 матчів (ділить 7-8 місце за кількістю ігор з Деннісом Бергкампом). Забивши 40 м'ячів за збірну, він деякий час був найкращим бомбардиром в її історії, доки його досягнення не було перевершене Робіном ван Персі.