Il se marie avec Margarethe Elizabeth Grunelius, connue comme peintre, (qui décède en 1802). De cette union naîtra un fils, Dietmar William, et une fille Susanne Katharina. Sa mauvaise santé l’oblige à quitter Munich en 1820 et à retourner à Francfort où il décède dix ans plus tard. Il est enterré au cimetière principal de la ville.
La correspondance de Sömmering est très riche, Goethe (1749-1832), Kant (1724-1804) ou Alexander von Humboldt (1769-1859) compte parmi ses correspondants réguliers. Les lettres qu’il échange avec Georg Forster (1754-1794) ont été publiées en 1878 par Hermann Hettner (1821-1882).
Sömmering est également un inventeur prolifique. Il travaille notamment sur des télescopes et sur un télégraphe électrique en 1809. Deux ans plus tard, il développe le premier système télégraphique de Bavière, actuellement conservé à Muséum allemand des sciences et des techniques de Munich. Il s’intéresse également aux aérostats (c'est lui qui réalise le premier ballon à air chaud d'Allemagne). Il travaille également sur de nombreux sujets allant des taches solaires au vin.
Liste partielle des publications
(de)Über die körperliche Verschiedenheit des Mohren vom Europär (1774)
(de)Vom Hirn- und Rückenmark (Mainz 1788, 2. Aufl. 1792) ;
(de)Vom Bau des menschlichen Körpers (Frankfurt am Main 1791-96, 6 Bde.; 2. Aufl. 1800; neue Aufl. von Bischoff, Henle u. a., Leipzig 1839-45, 8 Bde.) ;
(la)De corporis humani fabrica (Frankfurt am Main 1794-1801, 6 Bde.) ;
(la)De morbis vasorum absorbentium corporis humani (Frankfurt am Main 1795) ;
(la)Tabula sceleti feminini (Frankfurt am Main 1798) ;
(de)Abbildungen des menschlichen Auges (Frankfurt am Main 1801) ;
(de)Abbildungen des menschlichen Hörorgans (Frankfurt am Main 1806) ;
(de)Abbindungen des menschlichen Organs des Geschmacks und der Stimme (Frankfurt am Main 1806) ;
(de)Abbildungen der menschlichen Organe des Geruchs (1809).
Franz Dumont: Siemmerring, Samuel Thomas (von). In: Werner E. Gerabek, Bernhard D. Haage, Gundolf Keil, Wolfgang Wegner (Hrsg.): Enzyklopädie Medizingeschichte. De Gruyter, Berlin/New York 2005, (ISBN3-11-015714-4), S. 1341 f.
Ulrike Enke: Zum 250. Geburtstag des Anatomen Samuel Thomas Soemmerring (1755–1830). In: Hessisches Ärzteblatt. 1/2005, S. 21–24 (Digitalisat)
Peter McLaughlin(de): Soemmerring und Kant. Über das Organ der Seele und den Streit der Fakultäten. In: Soemmerring-Forschungen. Band 1, 1985, S. 191–201 (Digitalisat)
Rolf Siemon: Samuel Thomas Soemmerring (1755–1830). Schriften des Westpreußischen Landesmuseum (71). Westpreußisches Landesmuseum 2004. (ISBN3-927111-48-1).
Manfred Wenzel: Die Soemmerring-Edition der Akademie der Wissenschaften und der Literatur, Mainz. In: Acta historica Leopoldina. Nr. 20, 1992, S. 105–120.
Soemmerring-Forschungen: Beiträge zur Naturwissenschaften und Medizin der Neuzeit. Hrsg. von der Akademie der Wissenschaften und der Literatur in Mainz. Fischer, Stuttgart Bd. 1, 1985 bis Bd. 9, 1994 (danach Erscheinen eingestellt).