1618-ban a jezsuiták rendjébe lépett. A würzburgi egyetemen a matematika, filozófia, a héber és a szír nyelvek tanára volt. 1635-ben a harmincéves háború zavarai előtt Avignonba vonult. A pápa Rómába hívta, ahol a Collegio Romanoban[12] matematikát és héber nyelvet tanított. Kircher Rómát többé el nem hagyta, és később ott hivatalos foglalkozás nélkül élt. Kircher polihisztor volt, aki filozófiáról, matematikáról, fizikáról, csillagászatról vagy természetrajzi dolgokról épp oly szakismerettel írt, mint a hieroglifekről és archeológiai tárgyakról. A magyarországi elittel (Lippay György esztergomi érsek, Nádasdy Ferenc országbíró) is kapcsolatot tartott, akiknek műveket dedikált, a jezsuita rendházakban pedig többen leveleztek vele.[13]
Művei
Ars magna lucis et umbrae (Róma 1646)
Magnes sive de arte magnetica opus tripartitum (uo. 1641)
Pantometrum Kircherianum (Würzburg 1660)
Musurgia universalis (Róma 1650)
Iter exstaticum coeleste (uo. 1656)
Iter exstaticum terrestre (uo. 1657)
Mundus subterraneus, in quo universae naturae majestas et divitiae demonstrantur (Amsterdam 1664)
Alan Cutler: The Seashell on the Mountaintop, E. P. Dutton, New York (2003)
Steven Frimmer: The stone that spoke: and other clues to the decipherment of lost languages, G. P. Putnam's Sons (1969)
Erik Iversen: The Myth of Egypt and its Hieroglyphs, Koppenhága (1961)
Ralf Kern: Wissenschaftliche Instrumente in ihrer Zeit. Zweiter Band: Vom Compendium zum Einzelinstrument. 17. Jahrhundert. Verlag der Buchhandlung Walther König 2010, ISBN 978-3-86560-866-6
Joseph MacDonnell: Jesuit Geometers, St Louis - Institute of Jesuit Sources (1989)
Charles Musser: The Emergence of Cinema: The American Screen to 1907, University of California Press (1990), ISBN 0-520-08533-7
Totaro Giunia, L'autobiographie d'Athanasius Kircher. L'écriture d'un jésuite entre vérité et invention au seuil de l'œuvre. Introduction et traduction française et italienne, Bern: Peter Lang 2009, p. 430 ISBN 978-3-03911-793-2