Syn Marii i Franciszka Jakubiaków[2]. Bez powodzenia próbował aplikować do Wyższej Oficerskiej Szkoły Lotniczej w Dęblinie. W 1980 został absolwentem Centralnego Ośrodka Szkolenia Specjalistów Technicznych Wojsk Lotniczych w Oleśnicy na kierunku eksploatacja statków powietrznych (specjalność obsługa naziemna samolotów MiG-21)[1][3]. Następnie rozpoczął służbę w 1 Pułku Lotnictwa Myśliwskiego w Mińsku Mazowieckim, gdzie pracował jako technik przy obsłudze naziemnej samolotów[4][3]. W 1987 ukończył policealne studium zawodowe z zakresu organizacji pracy kulturalno-oświatowej[1]. Rok przed odejściem na emeryturę złożył wniosek o możliwość równoległego studiowania w szkole wyższej, na co przełożeni nie wydali zgody[5]. Odszedł z wojska w stopniu starszego chorążego w 1991, pełnił wówczas funkcję kierownika warsztatów łączności[6]. W jednym z wniosków paszportowych deklarował przynależność do PZPR, choć, jak sam później twierdził, do partii nigdy nie należał[7][8].
Działalność biznesowa
Prowadził w Warszawie własną firmę montującą telewizję kablową, przejętą przez Porion, a następnie Aster City Cable. Podjął studia na kierunku pedagogika na Uniwersytecie Warszawskim, których nie ukończył[3]. Po 1996 zasiadał w radzie nadzorczej i zarządzie browaru w Krotoszynie, który upadł z powodu zadłużenia. W 2002 Marek Jakubiak wykupił od koncernu Brau Union browar w Ciechanowie. Na bazie ciechanowskiego zakładu piwowarskiego zbudował w ciągu kilku lat przedsiębiorstwo branży browarniczej, a później holding BRJ. Zorganizował m.in. własną sieć dystrybucji, rozwijał produkcję piwa niepasteryzowanego (Ciechan Wyborne)[5][9][10]. W kolejnych latach poprzez swoje przedsiębiorstwo (spółkę Browar Ciechan, przekształconą w Browary Regionalne Jakubiak) nabywał i rozwijał produkcję w innych browarach regionalnych w tym browarze w Bojanowie i browarze Lwówek[5][9]. Grupa ta w 2014 produkowała ponad 30 marek piwa[10].
Według jednego z poglądów dzięki Markowi Jakubiakowi w Polsce zaczęła się moda na piwa regionalne[5][11]. Został laureatem Medalu Złoty Chmiel (2009)[12] oraz Nagrody im. Stanisława Wokulskiego (2013)[13].
W 2014, po jego uznanej za homofobiczną wypowiedzi na temat Dariusza Michalczewskiego, właściciele jednej z warszawskich klubokawiarni przeprowadzili akcję wylewania piwa produkowanego przez Browar Ciechan, a kilka innych lokali rozpoczęło bojkot jego produktów[14]. W 2018 Sąd Apelacyjny w Warszawie orzekł, że pozwany przez należącą do niego spółkę właściciel klubokawiarni nie musi płacić odszkodowania i pokrywać kosztów procesu, utrzymał jednak w mocy część wyroku stołecznego Sądu Okręgowego dotyczącą obowiązku zamieszczenia przeprosin[15]. Sąd ocenił jednocześnie, że wypowiedź przedsiębiorcy o sportowcu była przykładem mowy nienawiści[15].
W kwietniu 2020 Państwowa Komisja Wyborcza zarejestrowała jego kandydaturę w wyborach prezydenckich zaplanowanych na maj 2020[29], które to głosowanie się nie odbyło. W czerwcu 2020 PKW zarejestrowała jego kandydaturę na powtórzone wybory w tymże miesiącu[30]. W pierwszej turze otrzymał 33 652 głosy (0,17%), zajmując 8. miejsce spośród 11 kandydatów[31]. Przed drugą turą wraz ze swoją partią poparł ubiegającego się o reelekcję Andrzeja Dudę[32]. We wrześniu 2020 na zjeździe FdR Marek Jakubiak ponownie został wybrany na prezesa tej partii[33]. W maju 2023 został sekretarzem generalnym partii Kukiz15[34].