Douze équipes, dix issues des poules hautes et deux issues demi-finales de qualification des poules basses, jouent des matchs à élimination directe en matchs aller et retour. Les six équipes vainqueurs rejoignent en quarts de finale les deux équipes ayant terminé premières des poules hautes. Concernant les Final Four, un tirage au sort détermine les équipent qui s'affrontent en demi-finales.
Le classement indiqué devant chaque équipe est celui du la poule haute (par exemple, A4 signifie 4e de la poule A). De plus, K1 et K2 désignent les deux équipes issues demi-finales de qualification. L'équipe la mieux classée reçoit au match retour.
Huitièmes de finale
Les huitièmes de finale se déroulent du 16 au et du 23 au .
Champion d'Allemagne, le THW Kiel, triple vainqueur de la compétition, participe pour la sixième fois en sept éditions au Final Four.
Quatrième du Groupe A, avec un total de 17 points (8V, 1N, 5D), les Allemands est opposé au club hongrois du SC Pick Szeged en huitièmes de finale. Défait en terre hongroise 29 à 33, Kiel remporte le match retour à domicile sur le score de 36 à 29 et se qualifie donc pour les quarts de finale sur un score total de 65 à 62.
En quart de finale, les Allemands doivent affronter le tenant du titre, le grand FC Barcelone. Victorieux à domicile, 29 à 24, les Kielers parviennent à tenir le choc lors du match retour au Palau Blaugrana en ne s'inclinant que de trois buts 30 à 33, ce qui leur permet de se qualifier pour le Final Four.
Avec un total de 24 points (12V, 0N, 2D), le PSG termine en tête de son groupe et est directement qualifié pour les quarts de finale. Face au club historique croate du RK Zagreb, le club francilien réussit à infliger une lourde défaite de 20 à 28 sur le terrain de Zagreb et si le PSG est tenu en échec au retour par le club croate (match nul 32 à 32), cela n'empêche pas le club français de se qualifier pour son premier Final Four.
Vainqueur (0) : néant
Finaliste (0) : néant
Demi-finaliste (0) : néant
Effectif du Paris Saint-Germain lors de la saison 2015-2016
Avec un total de 21 points (9V, 3N, 2D), Kielce termine deuxième de son groupe derrière le FC Barcelone. Il affronte alors en huitièmes de finale le club biélorusse du HC Meshkov Brest, issu des poules basses. Vainqueur de quatre buts à l'extérieur (32-28), le club polonais ne se laisse pas surprendre lors du match retour à domicile en s'imposant 33 à 30.
En quart de finale, c'est le club allemand du SG Flensburg-Handewitt qui se dresse face à Kielce. La double confrontation entre les deux clubs s'avère extrêmement serrée puisqu'après un match nul 28-28 en Allemagne, Kielce s'impose d'un seul petit but 29 à 28 lors du match retour, une action litigieuse en faveur de Flensburg n'ayant pas été sifflée à la dernière seconde du match (le match nul 29-29 ayant été synonyme de qualification pour Flensburg).
Avec un total de 23 points (11V, 1N, 2D), Veszprém termine à la deuxième place de son groupe et est qualifié pour les huitièmes de finale. Face au club ukrainien du HC Motor Zaporijia, issue des poules poules basses, la double confrontation se solde par deux nettes victoires du Veszprém KSE (29 à 24 en Ukraine puis 41 à 28 à domicile).
En quart de finale, le club hongrois est opposé aux macédoniens du Vardar Skopje. Vainqueur du match aller 29 à 26 dans la salle du Vardar, le Veszprém KSE est tenu en échec au retour par le Vardar (30-30) mais se qualifie tout de même pour le Final Four.