Nel 1994, dopo un biennio positivo, viene prelevato nuovamente dallo Stoccarda, dove rimarrà per un quinquennio, formando un trio d'attacco molto valido con Giovane Élber e Krasimir Balăkov.[1] Nel 1994-1995 segna un gol in ognuna delle prime cinque giornate del campionato di campionato, compreso l'esordio in Bundesliga contro l'Amburgo,[1] stabilendo il primato di partite consecutive con reti segnate per un esordiente nel massimo campionato tedesco, poi battuto da Mohamed Zidan del Magonza nel 2011-2012.[1] Nel 1995-1996 si laurea capocannoniere del campionato con 17 gol e nel 1996-1997 vince la Coppa di Germania.[1]
Nel 1999 si trasferisce al Borussia Dortmund, di cui è il migliore marcatore stagionale nel 1999-2000 e nel 2000-2001. Dalla stagione 2001-2002 trova meno spazio in squadra e, dopo sole tre presenze, nel gennaio 2002 si accasa al Bolton, squadra della Premier League inglese in cui milita per alcuni mesi, in cui contribuisce al raggiungimento della salvezza con 4 gol in 15 presenze, tra cui una tripletta nella partita vinta per 4-1 contro l'Ipswich Town al Reebok Stadium.
Nel 2002 firma per l'Hannover 96, neopromosso in Bundesliga, dove realizza 14 reti in 27 presenze nel 2002-2003, contribuendo all'undicesimo posto della squadra. Nel 2003 è all'Hertha Berlino, con cui in due stagioni realizza 18 reti in 54 presenze. Nel 2006 chiude la carriera in Croazia, vestendo la maglia del Rijeka e vincendo la Coppa di Croazia.[1]
Dopo l'amichevole del 22 febbraio 1998 vinta a Riad contro l'Arabia Saudita (0-3), Bobic manca per un quadriennio dalla Mannschaft; il ritorno risale al 20 novembre 2002, in amichevole contro i Paesi Bassi (vittoriosa per 1-3 a Gelsenkirchen in amichevole). Convocato dal ct Rudi Völler per il campionato d'Europa 2004, disputa la rassegna in Portogallo. Non sarà preso in considerazione dal ct Jürgen Klinsmann, chiudendo di fatto l'esperienza in nazionale il 19 giugno 2004, nella partita dell'europeo portoghese pareggiata a reti bianche contro la Lettonia, con un bilancio di 37 presenze e 10 reti.