Коли антипапаХристофор узурпував папську владу, воєначальник Теофілакт, прихильник Сергія, ув'язнив антипапу. Ліутпранд Кремонський, один із прихильників папи Формоза, стверджував, що Христофора вбили за наказом Сергія III, що Сергій ІІІ користувався підтримкою Теофілакта та його дружини Теодори, більше того, співжив з їхньою дочкою Марозією і мав з нею позашлюбного сина, який пізніше став папою Йоаном XI.[3] Сергій III започаткував доволі тривалий період, який у папській історії називають порнократією чи, словами Чезаре Бароніо, «темним століттям» (saeculum obscurum).
Посівши папський престол, Сергій III відновив дію усіх рішень, які засуджували папу Формоза.