Il a passé son enfance en Algérie, où il a notamment étudié la Torah avec son rabbin. Il a ensuite fait des études en France, où il rejoint la Résistance. Il fait partie du Réseau Garel (Lyon, 1942-1944).
André Chouraqui fut avocat au barreau d'Oran (1940-1941), puis juge dans le ressort de la cour d'appel à Alger (1945-1947). Il est promu, en 1948, docteur en droit international public à l'Université de Paris.
En 1987, paraît chez Desclée De Brouwer sa traduction de la Bible à partir de la Bible dite massorétique, d'abord publiée par volumes à partir des années 1970. Marc Leboucher, qui fut le premier à éditer ce texte en France estime qu'André Chouraqui a adopté dans son travail « un parti pris révolutionnaire, qui a permis de redécouvrir des textes que l'on croyait usés » et qu'« il a surtout mis en lumière l'importance des racines juives du christianisme et rappelé que Jésus appartenait au peuple juif. »
Secrétaire général adjoint de l'Alliance israélite universelle (1947-1953), André Chouraqui en deviendra le délégué permanent, sous la présidence de René Cassin (1887-1976). Il fut également président de l'Alliance française de Jérusalem.
En février 1990, est publié L'Amour fort comme la Mort, autobiographie d'André Chouraqui qui sera ultra-médiatisée et se vendra immédiatement à plus de 100 000 exemplaires. La même année il publie chez le même éditeur sa traduction du Coran (texte et commentaires) et rencontre le Dalaï Lama[4].
Il était membre du comité de parrainage de la Coordination pour l'éducation à la non-violence et à la paix de la culture de paix et de non-violence.
Sa seconde épouse Annette est la fille du pédiatre français Gaston Lévy. Le couple a cinq enfants[5].
Lettre à un ami arabe, Mame, 1969, 266 p. Réédité JC Lattès 1994
La Vie Quotidienne des Hébreux au temps de la Bible, Rois et Prophètes, Paris, Hachette, 1971, 263 p.
La Vie Quotidienne des Hommes de la Bible, Paris, Hachette, 1978, 406 p.
Moïse : voyage aux confins d'un mystère révélé et d'une utopie réalisable, Paris, Flammarion, , 501 p. (ISBN2-08-081348-X).
L'amour fort comme la mort : une autobiographie, Monaco, Ed. du Rocher, , 544 p. (ISBN2-268-02887-9).
Le destin d'Israël : correspondances avec Jules Isaac, Jacques Ellul, Jacques Maritain, Marc Chagall et Paul Claudel, Paris, Parole et silence, 2007 (ISBN2845733348).
Les Dix commandements aujourd'hui : dix paroles pour réconcilier l'homme avec l'humain, Paris, Pocket, , 286 p. (ISBN2-266-11947-8).
