En , apprenant par la radio anglaise l'imminence de la déportation de 10 000 Juifs étrangers, le grand-rabbin Salzer et le pasteur protestantHenri Manen tentent de rencontrer le maréchalPhilippe Pétain mais ne réussissent pas mais voient, par contre, Pierre Laval, le président du Conseil. Ce dernier leur affirme : « Les déportations sont inévitables. Elles se font sur ma propre initiative[5]. »
En 1943, après la « visite » de la synagogue de la rue de Breteuil, le grand-rabbin Salzer prend des précautions. Les voisins de la famille, Raymond Bertrand et Joséphine Bertrand trouvent un refuge dans une pension de famille à Combloux, dans les Alpes, pour les deux enfants Salzer.
À la Libération, le grand-rabbin Salzer récupère toutes ses possessions placées chez ses voisins Bertrand. Les époux Bertrand sont nommés Juste parmi les nations, le .
Le Commentaire de Rachi sur le Pentateuque (T.I et II). Traduit en français par M. Israël Salzer... M. Joseph Bloch... M. Élie Munk...M. Ernest Gugenheim. Préface par le Grand-rabbinJacob Kaplan. Rachi, sa vie et ses œuvres par le rabbin Simon Langer. Comptoir du Livre du Kéren Hasefer: Paris, 1957.
Israël Salzer. La Gémara: Sanhedrin. Le Talmud de Babylone, traduit par les Membres du Rabbinat français: collection dirigée par M. le rabbin Élie Munk. Keren Hasefer ve-Halimoud, 1974.
(en) Donna F. Ryan. The Holocaust & The Jews of Marseille. The Enforcement of Anti-Semitic Policies In Vichy France. University of Illinois Press: Urbana And Chicago, 1996. (ISBN0-252-06530-1)
(en) Ruth Schwertfeger. In transit. Narratives of German Jews in Exile, Fight, and Internment During "The Dark Years of France". Frank & Timme GmbH, 2012. (ISBN3865963846), (ISBN9783865963840)